Según se establece en la Ley de Creación del Consorcio de Transportes de Bizkaia, es competencia propia de éste, la de gestionar el servicio público de transporte a prestar por el Ferrocarril Metropolitano de Bilbao y, al mismo tiempo, dejó establecido el sistema de gestión por el cual había de ejercerse aquella importante competencia, tratándose de la gestión directa por medio de una Sociedad Anónima constituida por el propio Consorcio y cuyo capital habría de pertenecer en su integridad a éste.

Esta Sociedad Anónima se constituyó ante notario en Bilbao en 18 de febrero de 1993, bajo la denominación de Metro Bilbao, S.A. asumiendo la gestión del Ferrocarril Metropolitano de Bilbao y la explotación del servicio público de transportes que a éste es inherente. Se rige por sus Estatutos aprobados por el Consejo General del Consorcio en su sesión de 12 de noviembre de 1992.

Es presidenta de Metro Bilbao, S.A. María Dolores de Juan de Miguel, Consejero Delegado Iñaki Prego Larreina y Director Gerente José Antonio López Ansareo.

El órgano de administración de la Sociedad es su Consejo de Administración que en la actualidad está formado por:

 PRESIDENTE

JOSÉ MARÍA OLEAGA ZALVIDEA
Dpto. de Vivienda, Obras Públicas y Transportes

 VICEPRESIDENTE

MIKEL TORRES LORENZO
Alcalde de Portugalete

 VOCALES

IBON ARESO MENDIGUREN
1er. Teniente de Alcalde del Ayuntamiento de Bilbao.

ANDONI BUSQUET ELORRIETA
Dpto. de Vivienda, Obras Públicas y Transportes.

MERCEDES FERNÁNDEZ SIMANCAS
Dpto. de Economía y Hacienda del Gobierno Vasco.

ITZIAR GARAMENDI LANDA
Diputada Foral de Transportes y Urbanismo.

ALFONSO GARCÍA ALONSO
Ayuntamiento de Barakaldo.

ERNESTO JOSÉ GASCO GONZALO
Viceconsejero de Transportes del Gobierno Vasco.

JOSEBA GOIKOURIA ZARRAGA
Alcalde de Erandio.

RICARDO ITUARTE AZPIAZU
Alcalde de Santurtzi.

IMANOL LANDA JAUREGUI
Alcalde de Getxo

JOSÉ ANTONIO LÓPEZ ANSAREO
Director Gerente

JOSÉ IGNACIO PREGO LARREINA
Consejero Delegado

ANTONIO J. RODRÍGUEZ ESQUERDO
Alcalde de Barakaldo

RAFAEL SARRIA ANSOLEAGA.